Sein Fachgebiet ist die Chirurgie des Bauchraums und der inneren Organe, seine Schwerpunkte sind die Tumore der Speiseröhre und der Bauchspeicheldrüse. Sehr viele Eingriffe führt Prof. Dr. Gebauer minimalinvasiv und mittels OP-Roboter durch. Auch in seiner Forschung sucht er nach Möglichkeiten, den Patienten die bestmögliche Therapie zukommen zu lassen.