Jochen A. Werner leitete von 1998-2011 die Marburger Universitätsklinik für HNO-Heilkunde, bevor er ins Krankenhausmanagement wechselte, zunächst als Ärztlicher Geschäftsführer an der Universitätsklinikum Gießen und Marburg GmbH und seit 2015 an der Universitätsmedizin Essen. Jochen A. Werner engagierte sich in seinen unterschiedlichen beruflichen Funktionen besonders in der Onkologie, von der Entwicklung minimalinvasiver Operationsmethoden bis hin zu Fragen um die bestmögliche datenbasierte personalisierte Medizin im Kontext des von ihm angetriebenen Smart Hospital Konzeptes.